تهدف اللجنة إلى رفع كفاءة الأطباء العلمية والمهارية وذلك من خلال أقسامها التالية :

أولاً : قسم الدورات التدريبية :

يهدف هذا القسم إلى رفع كفاءة الأطباء العملية والمهارية من خلال تنظيم دورات تدريبية نظرية وعملية فى مختلف التخصصات الطبية ويقدم خدمة تدريبية على أحدث أساليب التشخيص والعلاج كما يساهم فى عقد دورات نظرية وعملية فى جميع الأجزاء  للأطباء المتقدمين لامتحان الزمالة البريطانية باطنة وأطفال وكذلك ينظم دورة فى رسم القلب شهرياً ودورة فى الموجات الصوتية باطنة كل أربعة أشهر ( لمزيد من الاستفسار مراجعة اللجنة ).

يشرف هذا القسم على تنظيم الإجراءات الإدارية الخاصة بالمنح العلمية والدراسية المختلفة التى يقررها مجلس النقابة العامة لأطباء مصر بهدف رفع كفاءة مزاولة المهنة فى بعض التخصصات مثل منحة دبلوم ممارسة الطب النفسى بالتعاون مع جامعة عين شمس والشهادة التخصصية فى مكافحة العدوى والتى تعقد بالتعاون مع الجامعة الأمريكية وجمعية مكافحة العدوى وكذلك دبلوم إدارة الجودة الشاملة فى الرعاية الصحية والذى يعقد بالتعاون مع الجامعة الأمريكية ( لمزيد من الاستفسار مراجعة اللجنة ) .